牙囊在牙齿生长发育过程中起着不可或缺的作用。牙囊起源于外胚间充质，是包绕在成釉器周围的一层致密结缔组织，可发育成牙组织、牙周膜和固有牙槽骨，对牙齿萌出过程中冠方骨改建及基底部新骨形成起着关键性的调控作用。
牙囊早期包裹全部牙胚，冠颈部形成后牙根开始发育、并逐步突破牙囊，此时牙囊仅包裹牙冠并在牙颈部附着（图1）；
图1包裹牙冠的牙囊
随着牙齿的发育和成熟，牙冠逐步突破牙囊，牙囊开始向牙颈部萎缩、退化，牙齿萌出后残余牙囊与牙龈融合，而骨性埋伏阻生牙的残余牙囊无法与牙龈融合，将持续缓慢退化、纤维性变（图2），部分残余牙囊可能与牙槽骨发生粘连。
图2-a牙槽窝内遗留牙囊术后发生囊肿（术前）
图2-b牙槽窝内遗留牙囊术后发生囊肿（术后一年）
然而，牙囊在发育过程中同时存在囊肿化改变的潜在风险，有学者对影像学显示正常的智齿牙囊进行组织学观察，发现有30%-40%的牙囊存在囊性改变或可诊断为含牙囊肿（甚至角化囊肿、成釉细胞瘤）。
这些具有囊性改变特征的牙囊，如果牙齿不能正常萌出，埋伏阻生于骨组织内，将形成囊肿并逐渐扩大，其后在影像学检查时可直接诊断为牙源性囊肿。
临床如果早期微创拔除某些骨性埋伏阻生牙时，将牙囊遗留在牙槽窝内，就有可能是将囊肿组织遗留在牙槽窝内，术后一段时间后可能出现颌骨囊肿（图3）。
图3附着在智齿颈部的残余牙囊组织
因此，对于骨性埋伏阻生牙，拔除术中应该在牙槽窝内刮净牙囊组织，避免术后形成囊肿。
对于成年骨性埋伏阻生智齿，牙囊已退化为附着在牙颈部或与牙槽骨粘连的纤维性组织，附着在牙颈部的残余牙囊组织有的可随埋伏智齿的拔除一并带出，与牙槽骨粘连的牙囊残余组织，往往不能随着阻生牙的脱位而脱离牙槽窝，而依然粘附于牙槽窝的骨壁上，尤其以近中牙槽骨壁居多(图8)。
图4粘连于智齿牙槽窝近中骨壁的残余牙囊组织
临床很多低位埋伏阻生智齿位于第二磨牙牙冠远中下方，致使第二磨牙远中牙槽骨缺失。骨性埋伏阻生智齿拔除后，残余牙囊组织恰位于第二磨牙远中牙槽骨壁，如果未将残余牙囊组织刮净，残余牙囊组织（以纤维成分为主）将可能影响第二磨牙远中牙槽骨骨组织的再生（图5），术后第二磨牙远中极易遗留较深牙周袋样结构，导致牙周炎。
图5-a下颌智齿拔除术及正畸前
（左侧去除牙囊，右侧未去除牙囊）
图5-b下颌智齿拔除术后及正畸一年
（左侧去除牙囊，右侧未去除牙囊）
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